Python 读取 .gz 文件全过程
作者：努力沉淀
这篇文章主要介绍了Python 读取 .gz 文件全过程，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。如有错误或未考虑完全的地方，望不吝赐教
Python 读取 .gz 文件
读取.gz 文件需要使用gzip 包，如果没有安装可以自行在终端安装
pip install gzip
import gzip path = "" #你的文件路径 f = gzip.open(path, 'rb') for line in f.readlines(): # 按行进行读取 s = line.decode() # 读取之后要进行解码 print(s) # s 为string类型，就是我们读取的文件中的一行
也可以批量读取，批量读取文件使用os包对文件夹中的所有文件进行
import gzip import os\ path = "" #表示你要打开的文件夹 files = os.listdir(path) #files 是path中存放的所有文件名集合 for file in files: f = gzip.open(path+file, 'rb') for line in f.readline(): print(line)
Python 读取gz文件，字符串与字节串的相互转换
首先是字节串转字符串，也就是str：
b = b'some byte array' str(b, encoding = "utf-8") #or bytes.decode(b)
然后是字符串转为字节串：
s = 'some string' bytes(s, encoding = "utf8") #or str.encode(s)
fastq.gz文件读取
with gzip.open(fq,'r') as fastq: try: while True: line1 = next(fastq).decode() # 字节转字符串 line2 = next(fastq).decode() line3 = next(fastq).decode() line4 = next(fastq).decode() except: pass
以上为个人经验，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持脚本之家。