R语言-如何读取前n行数据
作者：炫炫有牛腩
通常我们读取文件时都会读取全部的文件然后再进行操作，但是当读取的数据量很大是读取的时间会很长，而且占用RAM，对于写测试代码有点不方便。
所以只读取前n行数据是一个挺不错的函数
##file：读取文件路径
##n：读取的前n行
##header：是否有标题行
readfile<-function(file, n=1000, header=T){
pt <- file(file, "r")
name <- NULL
if(header){
name <- strsplit(readLines(pt, 1), split=',')[[1]]; #读取标题
f1 <- readLines(pt, n)
data <- read.table(text=f1, sep=',', col.names=name)
}else{
data <- read.table(text=f1, sep=',')
}
close(pt)
data
}
测试，最近制作linux启动盘误将移动硬盘当U盘，要死要死的，近500G资料丢失，因为制成启动盘所以资料还找不回来。
所以没有大型数据做测试。
之前200M的文件本人电脑上读取前10000行也是秒读的。
(data <- readfile(file="mtcars.csv", n=5, header=T))
X.. X.mpg. X.cyl. X.disp. X.hp. X.drat. X.wt.
1 Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620
2 Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875
3 Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320
4 Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215
class(data)
[1] "data.frame"
补充：R语言（数据读写操作）
本节介绍一些实用的数据处理函数（如行、列合并），以及如何从各种数据源读、写数据。
实用函数
| 函数 | 含义 |
|---|---|
| length() | 对象的长度。如 2 行 3 列的矩阵，其长度为 6。 |
| dim() | 对象的维度。如 2 3 表示对象是二维的，有 2 行 3 列。 |
| str() | 对象的结构。常用于查看数据框各列的数据类型、或者因子的分级数量。 |
| class() | 对象的类。比如矩阵的返回结果是 matrix。 |
| typeof() | 对象内数据的类型。比如矩阵的返回结果是 integer。 |
| mode() | 对象的模式。比如矩阵会返回 numeric。 |
| names() | 对象中各成分的名称。 |
| cbind() | 按列合并多个对象。 |
| rbind() | 按行合并多个对象。 |
| objectname | 输出对象。 |
| head() | 输出对象的前部，对于数据框而言是前6行。通过 head(obj, N) 来指定输出前 N 行。 |
| tail() | 类似地，输出对象的后部。 |
| ls(NULL) | 无参数函数。显示当前所有对象的名称列表。 |
| rm() | 删除单个或多个对象。使用 rm(list = ls()) 可以删除除句点开头的隐藏对象外的所有对象。 |
一个 ls() 函数的例子：
a <- matrix(1:6, nrow=2, ncol=3)ls() # 目前的对象只有 a
‘a'
手动输入
使用需要赋值的 edit() 函数，或者无需写在赋值语句内的 fix() 函数。
dt <- data.frame(age = numeric(0), gender = character(0), weight = numeric(0))# dt <- edit(dt) # 需要自赋值# fix(dt) # 无需自赋值
遗憾的是，在 Jupyter Notebook 现行的版本中，尚且不支持 edit() 函数。不过用户可以使用 fix() 函数。
读取文件
关于怎样读取来自 URL 地址的网络文件，R 可以实现，但这里不做讨论。以下只讨论本地数据源的读写。
分隔符文件
利用 read.table() 函数即可。其常用的参数有：
read.table(file, [header=T/F, sep=" ", row.names=, col.names=, na.strings=,
colClasses=, quote=, skip=, stringAsFactors=T/F,])
其中，可选参数的含义大多较好理解：
header 表示文件首行是否是列名而不是数据；
sep 是列间分隔符；na.strings 指定一个字符向量，内部所有的元素在读取时会被转换为 NA；
colClasses 用于指派各列的类型，如 =c(“numeric”, “character”, “NULL”) 指定了前两列的类型并跳过了第三列；
skip 用于跳过文件的最开始的若干行；
stringAsFactors 为 TRUE（默认值）时表示字符向量按因子处理，设为 FALSE 可以提升大文本处理速度。
data.path <- paste(getwd(), '/data/iris.data.csv', sep='')dt <- read.table(data.path, header=T, sep=",")head(dt)
| X5.1 | X3.5 | X1.4 | X0.2 | Iris.setosa |
|---|---|---|---|---|
| 4.9 | 3.0 | 1.4 | 0.2 | Iris-setosa |
| 4.7 | 3.2 | 1.3 | 0.2 | Iris-setosa |
| 4.6 | 3.1 | 1.5 | 0.2 | Iris-setosa |
| 5.0 | 3.6 | 1.4 | 0.2 | Iris-setosa |
| 5.4 | 3.9 | 1.7 | 0.4 | Iris-setosa |
| 4.6 | 3.4 | 1.4 | 0.3 | Iris-setosa |
# 利用 str() 函数查看其信息str(dt)
'data.frame': 149 obs. of 5 variables: $ X5.1 : num 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 5.4 ... $ X3.5 : num 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 3.7 ... $ X1.4 : num 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 1.5 ... $ X0.2 : num 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 0.2 ... $ Iris.setosa: Factor w/ 3 levels "Iris-setosa",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
须知：
如果列名中包含空格，R 会将空格替换为句点。
多数情况下，stringAsFactors 可以设为 FALSE。但是本例中的字符变量表示植物的种类，此处读成因子是正确的。
函数 read.csv() 能够读取 csv 文件，但是功能不如 read.table() —— 后者能处理非 csv 文本。
处理 Excel 文件
读取一个 Excel 文件最佳的方式，是预先将其转为 csv 格式，并用上述的 read.table() 方法读取。
你也可以查找关于 xlsx 包的相关内容，来获知如何直接操作 xlsx 文件。此处略过不提。
可以看一下以前写的文章：
统计软件数据：SAS/SPSS/Stata
需要用到 foreign 包。
SAS：使用 read.ssd()。如果你安装了 SAS，可以使用 Hmisc 包的 sas.get()。
SPSS：使用 read.spss()，或者 Hmisc 包的 spss.get()。
Stata：使用 read.data()。
数据库
一个方法是使用 ODBC 接口。针对你的数据库类型，安装 ODBC 驱动；然后在 R 中安装 RODBC 包。
另一个方法是使用 JDBC 接口，只不过需要 RJDBC 包。
写入文件
在我们对于数据进行清洗之后，往往需要把清洗结果输出到一个新文件中。这里就以 csv 格式为例吧。一个通常的 write.table()/write.csv() 的例子：
write.csv(dt, "filename.csv", row.names=F)
其中 row.names 指定为 FALSE，否则第一列会生成行号一样的数据。
以上为个人经验，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持脚本之家。如有错误或未考虑完全的地方，望不吝赐教。