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R语言作图之density plot(密度图)的制作步骤

2021-03-11 10:16:44 作者：生信了

这篇文章主要介绍了R语言作图之density plot(密度图)的制作步骤,本文给大家介绍的非常详细，对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值，需要的朋友可以参考下

上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot)。

Step1. 绘图数据的准备

首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式，把excel保存成csv格式。
数据的格式如下图：一列表示一种变量，第一行是列名

在这里插入图片描述

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释：header=T表示数据中的第一行是列名，如果没有列名就用 header=F

Step3.绘图所需package的安装、调用

install.package(“ggplot2”)
#注释：ggplot2是目前公认绘图很强的一个安装包，如果已经安装，这句就不需要啦
library(ggplot2)
#注释：package使用之前需要调用(每次用前都要调用哦)

Step4绘图

p<-ggplot(data, aes(x = weight))
#注释：x轴表示weight，y轴表示频率就不需要指定啦
p + geom_density(color = “black”, fill = “gray”)
#注释：color是线条的颜色参数，fill表示填充颜色

在这里插入图片描述

Step5.美化

p + geom_density(aes(color = sex))
#注释:按照性别不同组改变线条颜色

在这里插入图片描述

p + geom_density(aes(fill = sex), alpha=0.4)
#注释:按照性别不同组改变填充颜色，alpha表示调整透明度

在这里插入图片描述

到这里你已经可以画出比较高B格的density plot了，不过有些同学可能有
特殊的要求，比如把两组的平均值画出来，那本小仙再小秀一下?

平均值数据格式

1.准备平均值数据并读取
mean<-read.csv(“your file path”)
2.画图
p+ geom_density(aes(color = sex), alpha=0.4)+
geom_vline(data = mean, aes(xintercept = mean, color=sex),linetype=“dashed”)
#注释:前面是和之前一样作图语句，在后面直接加上这一句就好啦，xintercept表示x轴截断线，dashed表示是虚线

在这里插入图片描述